Появление цветков на побеге означает переход растения в новый возрастной период — репродуктивный (рис. 18, Б).
Первое цветение у лилий наступает в зависимости от вида через 1—8 лет после посева семян. В репродуктивный период преобразование структуры побега у лилий окончательно завершается, и все растение приобретает характерный для данного вида внешний облик. Ежегодно луковица пополняется новыми чешуями, а опустошенные и засохшие наружные чешуи вместе с донцем и корнями отмирают. У молодых впервые цветущих репродуктивных особей число вновь сформированных чешуи превосходит число отмирающих. В результате размер луковиц увеличивается. С наступлением полной зрелости растения (средневозрастные особи) количество чешуи, образованных за год, и количество отмерших чешуи становится более или менее постоянным. С этого времени размер луковиц и количество чешуи в ней также сохраняется постоянным.
В репродуктивный период у лилий возрастает способность к формированию пазушных почек на побеге.