Водоросли — наиболее древняя и сравнительно простая по строению группа растений. Они играют большую роль в жизни высшей водной растительности. В аквариуме водоросли являются нежелательным организмом. Большинство их наносят большой вред высшим растениям: произрастая на листьях, снижают способность их к ассимиляции. Поселяясь на стеклах аквариума, они уменьшают интенсивность проникновения света к высшим растениям и, кроме того, ограничивают обзор внутреннего пространства аквариума, мешая наблюдению за жизнью в нем. Представители видов рода хламидомонада и рода осциллятория, развиваясь в больших количествах, вызывают цветение воды, а это в свою очередь приводит к повышению содержания углекислоты и ядовитых продуктов распада не только в аквариуме, но и в водоемах, что вызывает гибель рыб, а иногда и высшей растительности. Даже такие на первый взгляд безвредные представители видов рода кладофора, как волокнистые зеленые водоросли, развиваясь в больших количествах в прудах, используемых для разведения рыб, приносят вред, так как мальки запутываются в густых нитях водорослей и погибают. В аквариум водоросли попадают случайно: с водой, кормом и с растениями.
По своему строению, окраске и способам размножения водоросли делятся на несколько типов (отделов): зеленые, сине-зеленые, золотистые, диатомовые, желто-зеленые, пиррофитовые, эвгленовые, красные и бурые. Каждый вид имеет определенные требования к среде произрастания и развивается при определенных условиях температуры воды, длительности и интенсивности освещения, содержания минеральных и органических веществ, жесткости и рН воды.
Определение водорослей не требует специальной подготовки и вполне доступно аквариумисту.